Zbiory objęte projektem
W ramach projektu „Jagiellońska Biblioteka Cyfrowa” zabezpieczone, poddane konserwacji i zdigitalizowane zostały obiekty należące do Narodowego Zasobu Bibliotecznego (NZB). Narodowy Zasób Biblioteczny jest tworzony przez zbiory bibliotek mające wyjątkową wartość i znaczenie dla dziedzictwa narodowego, dlatego też podlega szczególnej ochronie. Choć termin funkcjonuje od lat 70. ubiegłego wieku, to do rangi kategorii prawnej podniesiony został dopiero w Ustawie o bibliotekach z 27 czerwca 1997 r. W 1998 r. ukazało się Rozporządzenie Ministra Kultury i Sztuki w sprawie ustalenia wykazu bibliotek, których zbiory tworzą Narodowy Zasób Biblioteczny, określenia organizacji tego zasobu oraz zasad i zakresu jego szczególnej ochrony. Załącznik do tego rozporządzenia tworzy wykaz bibliotek, których zbiory w całości lub części składają się na Narodowy Zasób Biblioteczny — Biblioteka Jagiellońska jest wymieniona w tym wykazie. Poza powyższym, w §5 w punkcie 4 tego rozporządzenia określono, że szczegółowa ochrona zasobu polega na utrwalaniu zasobu na innych nośnikach.
Okólnik nr 2 wydany przez Dyrektora Biblioteki Jagiellońskiej 8 listopada 2000 roku określa, że w Bibliotece Jagiellońskiej Narodowy Zasób Biblioteczny stanowią:
- zbiór rękopisów: w całości,
- zbiór starych druków: w całości,
- zbiór rycin, grafiki, ekslibrisów, fotografii: w całości,
- zbiór druków z XIX i XX w.:
- druki z XIX i pierwszej połowy XX w (do 1945 r.): druki zwarte, serie, czasopisma, druki ulotne: w całości,
- druki polskie z lat 1945–1968: druki zwarte, serie, czasopisma, dokumenty życia społecznego, literatura firmowa, normy i patenty: w całości,
- wydzielony zasób druków polskich wydawanych od 1969 r.: druki zwarte, serie, czasopisma, dokumenty życia społecznego, literatura firmowa, normy i patenty,
- wydzielony zbiór druków cennych i rzadkich „rara”,
- wydzielony zbiór dokumentów tzw. „drugiego obiegu”
- polonica zagraniczne po 1945 r.
- zbiór polskich dokumentów audiowizualnych i elektronicznych tworzony od 1997 r.
Z bogatego zbioru czasopism wyselekcjonowano do projektu te tytuły, które należało skopiować i utrwalić w formie elektronicznej w pierwszej kolejności. Były to te najchętniej czytane, jednocześnie najbardziej zniszczone, a także egzemplarze jedyne w kraju.
Razem: 1253 tomy czasopism i 1747 woluminów książek i jednostek zbiorów specjalnych.
Kontynuacją projektu Jagiellońska Biblioteka Cyfrowa był projekt Bezpieczne i kompleksowe udostępnianie zbiorów Uniwesytetu Jagiellońskiego w Internecie. Etap I, współfinansowany przez Unię Europejską w ramach Małopolskiego Regionalnego Programu Operacyjnego na lata 2007-2013, którego realizacja rozpoczęła się 1 października 2010 r. i trwała trzy lata. W ramach projektu digitalizacją objęte zostały zbiory pochodzące z Biblioteki Jagiellońskiej, Wydziałowej Biblioteki Prawniczej, Biblioteki i Fonoteki Instytutu Muzykologii UJ.